O Instituto Lar de Jesus mantém a escola regular de Ensino Fundamental, oferecendo aos seus alunos desde a Educação Infantil (Pré-escolar) e educação do 1º ao 5º anos. Nesta proposta de Formação Integral, a educação não se limita apenas à formação escolar, uma vez que proporciona aos seus usuários um maior período de permanência no Instituto, oferecendo um amplo atendimento, através dos Serviços de Proteção Social Básica, desenvolvidos nas diversas atividades que tipificam o atendimento em várias faixas etárias, incluindo as famílias participantes dos projetos.
    Os alunos que estão frequentando a 5ª série ou 6º ano do Ensino Fundamental em diante, em outras escolas da rede de ensino, também se constituem em usuários dos serviços de proteção oferecidos no Instituto, focados no Serviço de Convivência e Fortalecimento de Vínculos, através do qual são atendidas crianças, adolescentes, jovens e suas famílias, inclusive os participantes do Programa de Erradicação do Trabalho infantil.
    Com a implementação do Programa Educação Inclusiva: Direito à Diversidade, desde 2001 o Lar de Jesus obedece a uma necessidade ocasionada pelo recebimento de vários alunos com necessidades especiais, liberados das Escolas Especiais ao Ensino Regular. Assim, esses alunos freqüentam as classes regulares, de acordo com sua idade, inteiramente incluídos no contexto escolar, juntamente com as outras crianças.
Às famílias também é dado um amplo atendimento, que vai desde a assistência sócio-econômica, com atendimento de necessidades básicas, até o acesso a bens e serviços disponibilizados à comunidade.
    Assim, do Pré-Escolar à idade de 18 anos, quando os adolescentes são encaminhados ao mercado de trabalho, através do Programa Adolescente Aprendiz (convênio com a Caixa Econômica Federal), ou até idades mais avançadas dos Portadores de Necessidades especiais, o foco do trabalho oferecido pelo Instituto é voltado para atividades de formação ampla e cidadã, envolvendo e comprometendo as famílias no processo de educação e crescimento de seus filhos.
    Instituição e família, juntos, com o apoio das instituições do primeiro e segundo setor, conseguem a concretização de seus objetivos e diretrizes de atuação junto ao público alvo, cumprindo, plenamente, suas finalidades estatutárias e, mais do que isso, a missão para a qual foi constituída.